25を入れたときのログ。今回は高速化のために postgres.confのfsyncをoff にしておいた。

dropdb chembl_23
psql -l
createdb chembl_25
psql -l
pg_ctl -D /usr/local/var/postgres stop
# vim postgres.conf -> fsync=off
pg_ctl -D /usr/local/var/postgres -l logfile start
$ pg_restore -j 2 -d chembl_25_postgresql.dmp

• 23を入れたときのログ

華味で新年会をしました。

よだれ鶏とハチノス

アスパラの塩炒めとエビチリ

青梗菜の貝柱スープかけと小籠包

その後は安定のリパブリュー

次回のMishima.sykは３月下旬になりそうです。日程が確定したらお知らせいたします。

シグナル伝達

細胞の分子生物学
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13章は小胞体の移動の話。14章はミトコンドリアとか電子伝達系、こっちはまぁ知っているので流した。

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小胞体の話

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ERで膜タンパク質が作られるというモデルがいまいちピンとこなかった。膜貫通αヘリックスはどの段階で形成されるのか？転送装置蛋白質ってのはシャペロン的な役割も果たすのか？

• The structure of the mammalian Sec61 channel opened by a signal sequence

膜の話。あとでもう一度細かく読み直す必要がある。

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ヘリックスの双極子モーメントって主鎖だけで決まるのだろうか？

研究手法について

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概要だったのと知っていることが多かったので流し読み

遺伝子発現調節

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major grooveとminor grooveは「あ、そうか」となった。となると配列からmajorかminorか判別できるってこと？

それからmiRNAに関してもなんとなく理解した。3'UTRか、、、うまいことやるんだな。

• Argonaute

転写、翻訳、そして分解

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昔からTBPってよくわからんわと思っていたのだけど、構造見たらなるほどねーと思った。それにしてもTATAだからベンドするのだろうか？

それからエクソンってオーソログ間でかなり保存されていて(だから、配列アライメントでエクソンイントロン境界を決定するのが簡単)、昔はヒトのcDNAからマウスのオーソログをデータベースから探してきてプライマー設計、KOマウス作成のしごとをよく手伝っていたんだけど、あれって文字列操作ばっかりで、なんとなくリアリティがなかったのだけど、snRNPの構造結構解かれていておもしろそう。あとで論文追いかけてみよう。

ここ5年以上自分から年賀状は送らずに、届いた年賀状のみに返信していましたが、今年からfacebookかlinkedin、instagramを検索して、見つかったらコネクトしてメッセージを送ることにしました。

ただし、どちらでも探せなかったら放置します。

あれはpingみたいなもんであろう。