fedoraをアップグレードしたら

There are unfinished transactions remaining. \
You might consider running yum-complete-transaction first to finish them

というwarningsが出るようになった。

こういう場合はyum-utilsのyum-complete-transactionコマンドを使う

昨晩、家のサーバーをfedora8から(9にあげるつもりがねぼけてて)一気に10にあげてしまって、perlが5.10になってしまい、夜中までかかってCatalystとかPlagger関連のperlのモジュールをたくさん入れた。

で、Catalystのバージョンも最新のになったのだけど、blogシステムが動かなくなってしまい、あせった。というか、viewまわりの指定とか認証周りとか変わってるっぽいがそこらへんを修正してとりあえず動くようにしたが、週末にでもちゃんと書き直そう。

ついでにsubversionで管理していたblogシステムをmercurialに移行した。で、 この本読みながら、いじってる。

入門Mercurial Linux/Windows対応
藤原 克則
秀和システム / ￥ 2,310 ()
在庫あり。

hg serveでログがグラフ表示されるのが楽しくて、無駄にブランチ切ってマージしたりとかしてるが、pullとmergeの使い方がいまいちちゃんと理解できてないので、第3部のチーム利用の章がもっと厚いとよかったかもと思った。

昨晩からcl-wikiのソースを読んでる。cl-markdownは今の僕では歯が立ちません（むきー）。

print,princとかdefvar,defparameterの使い分けがいまいち分からん。特にdefvarはシングルトンみたいな性質が面白いが、単にdefvarが紳士的なだけであって、setfとかdefparameterで上書きできちゃうから使いどころが？とか思った。

(シングルトンっていう表現は変だな。)

それから、princのcはどういう意味とか気になったので調べていたら、g000001さんのエントリにぶつかったのであった。まめ知識は増えていく。

Chemistry::RECAPをGitHubに置けばいいんじゃないか、なんて思いユーザー登録した。

macbookで作業していて、

$ ssh git@github.com
Hi kzfm! You've successfully authenticated, but GitHub does not provide shell access.

と出るのだけど、実際にpushしてみると

$ git push origin master
Repository not found. If you've just created it, please try again in a few seconds.
fatal: The remote end hung up unexpectedly

と言われて全然先にすすまない。あーだこーだと2時間くらい格闘していて、いい加減嫌になってきた。

試しにfedora8の入ったlinuxからだとgit pushがあっさり通った。あーなにがいけないんだろうか？macbookからpushできないと困るなぁ。

あと、bioperlのMoose版プロジェクトを発見。bioperlのwikiにもあった。

あとでチェックする。

犬のワクチン接種のために三島まで。

長泉なめり駅前の福梅でうどんを食べて帰る。

牛肉うどん

久々の讃岐うどんだ。天婦羅も少しつまむ。

さらに、すぐ近くのYUZUKAでパンを買って帰った。

そういえば、富士市だとこのレベルのパン屋って見たことないなぁとかそんな話を車の中でしてたので、早速検索してみたら、よさげなお店をみつけた。

今度いってみる

Chemistry::RECAPというモジュールを書いたのでケモインフォクックブックも更新しといた。

• RECAPルールで構造を切断したい

インストールはダウンロードして

tar xvfz Chemistry-RECAP-0.01.tar.gz 
cd Chemistry-RECAP-0.01
perl Makefile.PL 
make 
make test
sudo make install

PerlMolのインストールと使い方は以下の書籍が参考になるかも。

オープンソースで始めるゲノム・プロテオーム・メタボローム解析
樋口 千洋
オーム社 / ￥ 6,090 ()
在庫あり。

富士宮で美味しい魚屋を捜してたまに彷徨ったりしてたんだけど、先日、ナイスなエントリを見つけて以来、行かなきゃと心に決めていた魚清へ。

今回はジャスコで買い物して北上してヨコゼキで日本酒を買ってさらに北上して富士宮北高を右折しつつ、ビオデリで買い物をしたら31でアイス食って、そのまま139に向かって進んだとたんに信号を右折して、警察署を通り越したら信号左折して、西松屋に駐車して、子供服など買いつつ、そのまま進んで交差点のとこで魚清に突入という、無駄のないルート(謎)を開拓できたので満足。

ビオデリの野菜のグリル。

相変わらず美味しい。

和布蕪はまぁまぁ。ホタルイカの旨さがヤバい。南部美人とあわせたが、予め目は取り除いておくべきだったなぁ。その場でとりながら食べたけどめんどくさかった。

今度は魚を買おう。

読んだ。

従来の仕組みは崩壊し、自分の仕事は、いつ機械に置き換えられてしまうかわかりません。だからこそ、自分が今利用している仕組みがなくなったときのことを考えておかなければならないのです。

小飼弾の 「仕組み」進化論
小飼 弾
日本実業出版社 / ￥ 1,575 ()
在庫あり。

• リーダーの笑顔は「義務」
• アウトソーシングは、自分でコントロールできる要素を減らす
• 仕組みがどうしてもうまく回らないときは、レイヤーを上げて考えてみる

U隊長につけナポブームがきたのでいってきました、アドニスへ。店構えはごく普通の寂れた喫茶店ってな感じで、たばこ屋兼みたいな。

つけ富士リタンは、いまどきのつけ麺だった。

トマトソースのスープの中には広めの鶏肉と半熟タマゴが。そしてチーズが。麺は縮れた太麺で極太つけ麺の感覚で、桜海老と絡まりまくった油（オリーブオイルか？）。スープも麺もオイリー。

トマトソースつけ麺として食べるなら滅法旨いが、気持ち酸味が効きすぎているかな。塩気がもうちょいあってもよかったのと、スープ割り（みたいなもの）が出来れば嬉しいところ。

いっぽう、11時くらいから出してて12時過ぎにはもう売り切れてたのだけど、それって商売としてどうかとは思う(似たようなこと書いてるヒト発見)。まぁ、仕込みの関係で数が作れないのかもしれないし、一過性の可能性もあるので、慎重になっているのかもしれないけど、、、まぁいいや。

イタリアンパセリは二年草で去年丁度処分してしまったので新しいのを調達。青じそは種からまいておいた。今年はバジルを多めに育てる予定。ミントは植えてもどうせ飲まないからと却下された。

山椒も気になるので調べたらプランターでいけそうなので一つ植えといてやるか。

種からだと面倒なので苗を購入。娘は花を植えてた。