パターン認識と機械学習を読み直していて今4章。

図4.7のパーセプトロンのイメージが大変わかりやすいことに気づいて感激したのであった。

パターン認識と機械学習 上 - ベイズ理論による統計的予測
C. M. ビショップ
シュプリンガー・ジャパン株式会社 / ?円 ( 2007-12-10 )

いまは、Pinheiroを読むのに苦労している。

Mixed-Effects Models in S and S-PLUS (Statistics and Computing)
José Pinheiro
Springer / 2859円 ( 2009-04-15 )

これをきちんと理解しないと、PK-PDが進まないんだよな。

Pharmacokinetic-Pharmacodynamic Modeling And Simulation
Peter L., Ph.D. Bonate
Springer / 7596円 ( 2005-11 )

余計な変数多いな。

public class SkiFriction {

    public int bestPosition(String sF, String pF) {
        int sFl = sF.length();
        int pFl = pF.length();
        if(sFl >= pFl) return 0;
        int result = 0;
        for(int i=0;i<pFl-sFl;i++) {
            int lmax = 0;
            for(int j=0;j<sFl;j++){
                int k = sF.charAt(j) - '0'+ pF.charAt(i+j) - '0';
                if(k>lmax) lmax = k;
            }
            result += lmax;
        }
        return result;
    }    
}

数字の比較はMath.max使えばいいのか

純米おりがらみ

微発泡なので、シュワシュワ感がある。

最近、燗つける病が再発してたのだけど、楽しく飲めた。でも、僕の求める方向ではないかも。

reverseってメソッドはないのかな？ 両方ソートして、一方は先頭から他方は後ろから掛けてsumを求めた。

import java.util.*;

public class RoyalTreasurer {

    public int minimalArrangement(int[] A, int[] B) {
    java.util.Arrays.sort(A);
    java.util.Arrays.sort(B);
    int result = 0;
    for(int i=0;i<A.length;i++)
        {
        result += A[i] * B[A.length - i -1];
        }

    return result;
    }   
}

• SRM433 DIV2 250

nlmeを使いこなすために。

Mixed-Effects Models in S and S-PLUS (Statistics and Computing)
José Pinheiro,Douglas Bates
Springer / ￥ 5,742 ()
在庫あり。

• fixed effects:平均に影響を及ぼす
• random effects:分散に影響を及ぼす

ergoStoolのサンプルを。

residual plot(p.21)

• 全ての効果に対する因子はanovaで評価する必要がある
• the mean response across the population would be zero.

滑りに行きたい病

本棚を整理して、よく読む本屋や積んである本の場所を用意してみた。今読ん出る本はまた別の場所にある。

一通り読んでみてScalaは結構楽しそう。

Liftは気になるけどまだ読んでない。

java勉強中。

import java.util.ArrayList;
import java.util.List;

public class TheQuestionsAndAnswersDivTwo {

    public int find(String[] q) {
        List qlist = new ArrayList();
        int ans = 0;
        for (int i = 0; i < q.length; ++i)
            if (!qlist.contains(q[i]))
                qlist.add(q[i]);

        ans = (int) Math.pow(2, qlist.size());
        return ans;
    }

}

Set使えばいいのね。

• コレクションフレームワーク
• javaの道

Linear Mixed Effects Models

Pharmacokinetic-Pharmacodynamic Modeling and Simulation
Peter Bonate
Springer / ￥ 8,616 ()
在庫あり。

理論的な説明をさらっとやって例へ。Tumor Growthの薬剤Xの抑制効果が有為かどうかという例だった。

正直、よくわからんかった。MLとREMLの使い分けとか。

あとで読みなおそう。

普段はCAM::PDFを使っているのだけど、pythonでPDFからdoiを抽出したくなったのでpyPdfを使ってみた。

#!/usr/bin/env python
# -*- encoding:utf-8 -*-

from pyPdf import PdfFileReader
import re

doi_re = re.compile("10.(\d)+/([^(\s\>\"\<)])+")
input = PdfFileReader(file("1267.full.pdf", "rb"))
text = input.getPage(0).extractText()

m = doi_re.search(text)
print m.group(0)

結果

10.1124/dmd.107.019711.ABBREVIATIONS:PKPD,pharmacokinetic-pharmacodynamic;HGF,hepatocytegrowthfactor;PF02341066,

dmdだとdoiと文字の境目が切れないので余計な文字もついてきてしまうなぁ。prefixとsuffixを見ながら判断するようにするのがいいかな。

それにしても、meta情報のtitleに埋め込まれてたり、本文の1page目に書いてあったり、ファイル名そのものだったりと、論文からdoiを抽出するのは結構めんどくさいんだよなぁ。