colinux(debian)にBioperlとPerlMolをインストール

colinuxはtelnetとftpの設定してしまえば、後はpoderosaみたいなターミナルソフトでアクセスだ(colinuxのコンソールは使いづらい) あとキーボードを日本語対応にしたり、タイムゾーンを変更したりはココ参照だ。

とりあえず、せっかくdebian入れたことだし、sargeにアップグレードしておく。/etc/apt/source.list変えて、コマンドポチポチするだけダ。apt-getかなり便利と思った。

さて、Linux側の環境を整えたら、BioperlPerlMolをインストールするヨ。

  • PerlMol
  • オブジェクト指向で化合物とか反応を扱う。酸クロとかの反応用のモジュール作っておくとさらに便利。ただし、蛋白質とかの巨大なものを扱うにはどうじゃろか?今ひとつな気もする。構造立ち上げとかしっかりしてくればかなりいいツールになるんじゃないかと思っている。
  • Bioperl
  • とりあえずお約束。フォーマット変換とかは便利。ただし、モジュールの質はまちまち。ドキュメントに不備がある場合、直接コードを読むことになるが、そういうモジュールに限って泣きたくなる度が高い。で、結局自分で書いちゃったみたいな。

PerlMolはCPAN経由で入れる。

perl -MCPAN -e 'install PerlMol'

BioperlはCPAN経由だとやたらとはまって口が半開きになって、なんでだよチクショーなんてむかつきまくってイカリンコ汁が漏れるので、素直にapt-getで(それが大人スタイル)。

Package: bioperl

素直にしこしこapt-get installしましょう。blastとかclustalwなんかも一緒に入れておくと良いですぞ。

EclipseでEmacsキーバインド

Eclipseでもキーバインド変えられるのね。早速変更していい感じ。

Emacs風キーバインド

colinux+debian

いつも持ち歩いているR4にはActivePerlを入れていたんだが、PPMだとperlmolがしょぼかったり、Bioperlもあれなので、プログラム書く気が起きんヨ。かといって、Knoppixもなぁ(というかR4にCDROMドライブついてないし)で、coLinux入れてすこぶるいい感じ

  • ホストのWinをゲストのdebianのクライアントみたいに使えるのでいつも使っているWinの環境でそのままLinuxにアクセスできる
  • ブリッジすれば、そのままサーバーとして使えるので、HTTPのテストに使ったり、まぁいろいろ便利
  • もちろんdebianでapt-get使えたり、CPANもOK

ERROR STORM参考に、Cooperative Linuxを入れる。設定ファイルのデフォルトがc:coLinuxだったのでインストール先もそこにした。設定のXMLファイルはディレクトリの大文字小文字を認識しているっぽいので注意。 あと、Root Filesystem imageのダウンロードがうまくいかなかったので、sourceforgeから直接落としてきてeoで解答して、c:coLinuxroot.imgという名前で保存。あとは、default.colinux.xmlをちょっといじれば起動する。一応気持ちメモリを増やした(64->128)

毎回DOS窓開いてコマンド打つのもだるいので、ショートカットのプロパティに引数指定してcolinux-daemon.exe -c default.colinux.xmlなんかにしておいてスタートアップに登録すれば、こんな感じに起動がラクチン

colinux

あとWinXPでのブリッジってブリッジしたい接続を選択して右クリックすればいいだけなのね。知ってしまえば楽勝なネタだ。

桜田

烏丸仏光寺の桜田でお昼のコースをご馳走になって今回の京都は終了となります(名残惜しい)。

佇まいもいいし、仲居さんも綺麗です。(綺麗ってのはシャキーンっとしてるっていう意味で)。

先付けは鰆と栗、湯葉、イクラ、とんぶり等。とんぶりは菊の花と和えてあってほんのりわさびの味がして旨かった。

椀物はほたてとかぶらの吸い物で柚子がのっています。椀物最高。というか、なんで椀ってこんな旨いんだろうってつくづく。家では出せない味。僕のしょぼいデジカメ写真だと黒い椀と白いホタテの色が飛んじゃいますが、実際はすごく綺麗。

造りはまぐろとぶり?聞くの忘れた。コレは無難に美味しかった。

あなご、栗、銀杏をもち米で蒸したのは最高に旨かった。朴葉が下に敷いてあったので多分一緒に蒸しあげたのだと思うが。

海老芋、厚揚げ、しいたけに餡をかけたの。海老芋のねっとり感ととろけるような餡がたまらん。

これも色が飛んでしまってるが、とき鮭の茶漬けです。赤蕪が浅くつけてあって旨かったのと、緑の謎の漬物がほんとにいい感じ。茶漬けはいうまでもないでしょう。

デザートは胡麻ババロアの周りにりんごゼリーと葡萄を並べてワインゼリーをかけたもの。すっきりしていてよかった。胡麻と酸味の組み合わせがどうなのかなぁなんて思ったが、ゼリーもババロアも美味しかった。

秀太

サントムーン(総合スーパーっつうか複合施設)の南側にラーメン屋(ラーメンダイニング?)ができてたらしいので買い物ついでに軽く寄ってみた。

ダイニングです、マジで。小洒落た店内に、小洒落た、木製カウンター、そして、店員の制服まで小洒落てマスヨ。

秀太 秀太

店内はサントムーンすぐだけあって、親子連れでごった返し中。テーブルとかカウンターも一席あたりの余裕があってよさげ。

塩ラーメンに揚げ味玉の注文。

塩ラーメン

冷めにくい深い器を使ってマスゼ的な薀蓄が書いてあるように、器は深め。まぁ結構見るけど。でも白い器はお洒落です。

塩ラーメンには、トッピングに海苔と蒲鉾とチャーシューと葱がのっています。細麺頼んだので、麺は縮れ細麺だ。湯で加減は歯ごたえが残る系で好きな感じ。でも、スープ旨くない。なんツーか味が単調すぎるんだよね、一本調子。U隊長も醤油ラーメン頼んで同じこと言ってた。

例えると、

自分でとった蕎麦の辛汁

コレだね。さらに、例えると

スカスカのラガジャングル

結論:もうちょいコクが欲しいゾ。

秀太

ちず窓

ちず窓便利。

はてなマップといい、調子いいサービス増えてるナ。

livedoormapも地図にトラックバックできた時にはスゲーとか思ったけど、なんか最近トラックバックがおまけみたいになってるしな。

登録に関してはちず窓みたいにクローラーに巡回させるタイプがいいのか?実際のとこ、ユーザーにしてみれば手間はあんま変わんないけど。ユーザー登録させて、ちず窓作成履歴を残し、且つ、ユーザーにカテゴライズさせるあたり、マーケティングな情報収集はちず窓のほうが優れてイルっぽいゾ。あとはトラックバックスパムもはじきやすいのかな。

喜八郎

御殿場のペットランドに、無料ドッグランがあるというのではなをつれてちょっくら出かけてみた。

そのついでに久々に喜八郎に行ってみた。

意外に混んでた

ラーメン(塩)を注文。受けた順につくるようなので、人数というよりグループの数でわかる。ちなみに1,2,1,1,2と入ると最後に入った我々(二名)は5サイクル目になるようだ。こだわりかな。RISC対SISC か? ちなみに、あるラーメン屋では釜に4玉以上入れると湯であがりが悪くなるのでそれ以上は一度には入れないと言ってた。だから、1,2,1,1,2と一度に入った場合は最後の二人は2サイクル目(か3サイクル目)に喰える。

さて、塩ラーメン。スープにコクが出ているのと焦がしたまねぎが散らさないで一箇所にまとめるようになっている。味にまとまりが出てて旨くなってるね。満足。

あと、待ってる時間に隣でU隊長がメニューをいじってたら、裏側に、、、今度頼んでみよう。っていうか、隣の人はそれとも違うメニューを頼んでいたぞ。

来週から季節限定麺が味噌に替わるようだ。

喜八郎

ITFORストッポ

携帯電話のGPS絡みで ITFOR(4743.T)がストップ高でしたな(あんま持ってないけど)。

で、誰かやるやろと思ってYahoo掲示板を探したんだけど見つからず。YahooはAA駄目なのかな?

2chで探すのもだるいし、せっかく大事な会議中に思いついたので張っとこ。

IT4 :IT4:2005/12/15(木) 22:34:22 >>ITフォーーーーーーーーーーーーー!!!!!!!!!     ,、i`ヽ                        ,r‐'ァ   `ヽ::                      ::´    ヽ ヽ        , -‐--、         / /     ヽ \      I:::::::I_      _ / /      ヽ  ヽ    i,(;;;ノI、;;;)l    ,,/  , '       ヽ  ` ー 、.,,ゝ´ヮ`,ノュ_, - '   r'         ` 、_ /::: `山':::::    /          ヽ:::::::::::|::::::::"",r‐'           〉::::::::|::::::::::¨/          /;;;;;;;/;;;;;;;;;;/         /;;;;;;;/:::::::::::《         <;;;;;;;《:::::::::::::ヽ       /   ヽI,r''"""^~ヽ      /   ,/ ヽ    ヽ

AAはここから拝借

Class::DBIで複数カラムの主キーがjoinできない

IDとバージョンを外部キーにするOracleデータベースの検索をする必要があって、色々といじった。

SELECT a.name FROM a , b WHERE a.id = b.id AND a.version = b.version

まず、複数のキーを主キーにしている場合にIDというカラムがあるとエラーが出る。これよくわからん。

続いて、Class::DBI::Viewで扱おうとしたが、参照しかできないユーザー使っているので、テンポラリのテーブルが作れず。試しに普通の権限で実行してみたが、これも同じエラーが出て駄目。オラクルが悪いのか?

TemporaryTableが駄目なのか?と思い、use Class::DBI::View qw(SubQuery);でやってみたけど、どう書いたらいいのかよくわからん。

sub setup_view { my($class, $sql) = @_; $class->table("($sql)"); # Sweet }

ってなっているから、副問い合わせだけ書けばいいんダヨナァなんて悩むも、よく考えたら

副問い合わせで複数カラムって駄目ジャン

結局set_sqlで普通にSQL文書いた。

オラ狂ぅ

Meadowでバッファ切り替え

firefoxPoderosaもタブ式のブラウズに慣れてしまうと何でもタブのほうがいい気がしてくる。

XEmacsなんかはタブになってて便利なんでMeadowでもタブに対応してないかなと調べてみたが、どうもないみたい。

代わりに、ショートカットでは切り替えるみたい。

Meadow/Emacs memo: バッファリストとバッファの切り替え

Windows ではソフトの切り替えがAlt-TABで可能です. これと同じような操作を実現するのが pc-bufsw.el です

早速入れてみたら至極便利。要するに簡単に切り替えられることが重要なだけかも。firefoxもCtrl+Tabでタブ間の移動できるし、そういう指の操作を統一したいだけなのかもネ。