Drkcore

Planet R

Planet Rがあった。

早速購読。

あとRとBioconductorを用いたバイオインフォマティクスが気になる。

が、Amazonだと洋書しか出てこない。

06072007 wiki

FSWIKIをpng対応に

職場Wikiとして利用しているFSWIKIのpdf出力でpngを埋め込みたかったのでPDFJを0.90にあげた。

要するに、PPTをpngで出力して、そいつをWIKIに貼り付けつつ、pdfにも埋め込んで報告書を書くのを楽にしたいという、、、。jpgは汚くなってしまってだめです。

というわけでただ入れ替えたらfloorっていうサブルーチンがねーとかいうエラー。

Labyrinthine Code - PNGに関する資料によると、floor(x)はxの小数以下を切り捨てる関数らしいのでfloorをintに変更して　　　　#vec($clear,$x,8)=(vec($line,$x,8)+floor((vec($clear,$x-$bpp,8)+vec($prev,$x,8))/2))%256; 　　　　vec($clear,$x,8)=(vec($line,$x,8)+int((vec($clear,$x-$bpp,8)+vec($prev,$x,8))/2))%256;

解決、、、かな?

05072007 javascript

Mochikitの角丸めの関数

Mochikitの角丸めの関数はdivとかでpadding入れるとずれてしまうので困った。div->divって入れ子にするのもどうかと思うが、とりあえずいきあたりばったりの処理。

04072007 blog

はてなブックマークのこと

jspeedのDDNSが有料化するらしいのと、ロボットがひどくてしょっちゅうスワップするようになったのと、あれやこれやと家庭の事情で光化しそうなので、blosxomから他のに乗り換えようと色々触ってます。turboblogとかgibeとかtypefaceとか(wordpressも)。

turboblogとかエントリ書くのにwysiwygだったりとかして一見使いやすそうだったりするんだけど、書き続けられるかとか考えたときにうーんとなってしまう。wysiwygはwysiwygが必要なひとのためだけにあるんではないか?と最近は思ってます。

なんで、ここはpyblosxomかなぁとかいって一週間ほど時間を見つけていじってたのだけど、タギングがプラグインなのと、エントリ増えたときに遅くなりそうな実装だったので、却下の予感（ボット恐怖症）。

これで行こうと思えるものがなかったので、結局Catalystでシコシコ書いてる。Catalyst+Mochikitの組み合わせでやる気。最近Web Standards DesignとかAjax デザインパターンとか読んだのでAjaxとかCSSとかいじるの楽しいという事情もあったりするわけだが。

Ajaxデザインパターン ―ユーザビリティと開発効率の向上のために
Michael Mahemoff
オライリー・ジャパン / 5040円 ( 2007-05-15 )

実践Web Standards Design―Web標準の基本とCSSレイアウト&Tips
市瀬裕哉
九天社 / ?円 ( 2007-02 )

コメントは、はてなブックマークでつけられたコメントをblosxomにインクルードみたいにしようと思ったが、はてなブックマークのコメントは基本的に対話とは無関係だから、短文の感想だよなと改めて思った。

02072007 静岡

小太郎でラーメン

富士にもあったので寄ってみた。

九州のトンコツラーメン。麺細めでストレート。

久々に食べた。

02072007 Python

optparseでコマンドラインオプション解析

perlでいうGetopt::Long のようなものはgetoptでおこなえる。が、pythonにはさらにoptparseなるものがあるらしいので、今回そっちを使ってコマンドをつくってみた。

6.21 optparse -- より強力なコマンドラインオプション解析器

optparse モジュールは、getopt よりも簡便で、柔軟性に富み、かつ強力なコマンドライン解析ライブラリです。 optparse では、より明快なスタイルのコマンドライン解析手法、すなわちOptionParser のインスタンスを作成してオプションを追加してゆき、そのインスタンスでコマンドラインを解析するという手法をとっています。optparse を使うと、GNU/POSIX 構文でオプションを指定できるだけでなく、使用法やヘルプメッセージの生成も行えます。

オプションとヘルプ用の情報を一緒にaddする。

#!/usr/bin/python

import sys, re
from optparse import OptionParser

parser = OptionParser()
parser.add_option("-i", "--input", dest="input",
                 help="read from MOL2 FILE", metavar="FILE")
parser.add_option("-o", "--output", dest="output",
                 help="write to GAMESS INPUT", metavar="FILE")
parser.add_option("-t", "--type", dest="type",
                 help="select calcuiation type", metavar="TYPE")

if __name__ == "__main__":

   (options, args) = parser.parse_args()

-hでヘルプが出力される。

$ ./test.py -h
Usage: test.py [options]

Options:
  -h, --help            show this help message and exit
  -i FILE, --input=FILE
                        read from MOL2 FILE
  -o FILE, --output=FILE
                        write to GAMESS INPUT
  -t TYPE, --type=TYPE  select calcuiation type