Drkcore

07122005 ncbi

PubmedでRSS配信

やっとPubmedがRSS配信するようになったのね。

pubmed rss

というわけで、PubmedのRSSをbloglinesかfeed on feedsでチェックすればよいんだけど、既読と未読の管理をしないと効率よく捌けないので、なにか作らないといけないな。

Catalyst使うときが近づいているのか？

なんて。

07122005 bioperl

Bio::Biblio

PubMed ID から論文のリファレンスを作成して表示するプラグインが欲しいのでbioperlにいい感じのスクリプトが転がってないか調べていたのだが、どうもナサゲ。というより、実はちゃんとみたのが初めてだが、EBIとbless多め、サンプルスクリプト少な目な感じです(biblio関連だけ？)。

半日ぐらい費やして眺めていたらBio::Biblio*あたりはなんとなくわかったが、フェッチするとopenBQSに行ってしまう。-accessでNCBIに変えられるみたいだがイマイチいいサンプルがない。

bioperlに頼らずEutilsのRESTとXML-Parserでゴリゴリやったほうが早かったが、ワンライナーは便利だ。

$ perl -MBio::Biblio -e 'print new Bio::Biblio->get_by_id ("15931766")'

というわけで、週末にでもblosxom用のpubmedリファレンス用のプラグインを作ります。

07122005 blosxom bioperl

pubmedプラグイン

blosxomでpubmedの文献リストをってことで、

<pubmed> 12368254 15949046 15942029 </pubmed>

みたいに書くとpubmedからタイトルとかとってきて表示してくれるプラグインを作ってみた。

12368254 15949046 15942029

結局NCBIのEutilsを使ってリストを作ってそれをキャッシュするようにした。後は、NCBIの文献情報にリンク張ったり、表示のおかしいとこなおしたりせねばならんが、、、、、

bioperlでproxy

こんな感じに設定する。環境変数設定しとけばいいみたいな気もしたし、そういう記述も多かったので、ちょっとはまった。

use Bio::DB::GenBank; $gb = new Bio::DB::GenBank; $gb->proxy(['http'],'http://proxy:port');

http://oshiete1.goo.ne.jp/kotaeru.php3?q=1485665

07122005 music itunes

HOT! HOT! - CO-FUSION

今週のiTMSのフリーダウンロードはHOT! HOT!なので早速落として聴いてます。こういったベタな曲も好きだ。まぁ、なんつーかわかりやすい。

で、ジョンつながりというか、強引にもっていきますが、朝霧にSURGEONきやがりますな。強がってイカネーヨとか言ってはみたもののちょっと後悔したかも。でも追加駐車券が本栖湖はナイだろうに。

SURGEONだけだったら強がってられたけど、smith & Mightyと琉球ディスコもくるもんなぁ。

まぁ、みんな楽しんできてくださいってことで。でも最近結構寒くナってきてるヨ。

07122005 iTunes

iPod nano購入

2G(白)を購入した。muvo slimだとAACのインポートができないので、だんだん面倒になってきた。

アイポッポは大きすぎるし、シャッフルはあまり欲しくなかったんだが、ナノはちょうど僕のニーズにマッチしていたのでとうとう買った。

07122005 mt-daapd

iTunesの曲を移す

前のマシンには80Gの音専用HDDに30G以上の音ファイルを入れてあった。新マシンでは、サーバのmt-daapdから音を流していたが、流石に、新しいCDを買うたびに古いマシン起動して、Linuxにミラーリングすんのも面倒だ。ってことで、バックアップも兼ねてDVDに焼きながら今まで溜めた曲を新マシンに移そうということになった。

いやまぁ余裕でしょOK？なはずだったが、クレモンティーヌとかロイクソップとか不正な文字?が続出。で、DVDに焼くのは諦めた。

じゃぁ次に考えることは、NFS(Winだと共有?)経由で移せばいいじゃんとか思ったが、すべて無線LAN化しているうえ古いマシン（送信元）には11bの無線LANをつけているので、この上なく遅い。だめもとで試してみたけど、予想通りイラついた。

結局パソコンを分解して、HDD付け替えしようという、最初からやればよかったジャン的な発想に落ち着いて分解開始。

旧マシンは無事にHDDを摘出され、さくっと、再起動。やっぱこやつは腹をいじられ慣れてます、8年近く付き合っている筐体は手になじむ（でもそろそろ用済み）。

続いて新マシンの施術に取り掛かる。最近の筐体は手回しねじで腹が開くのか～と感心しながら開くと、、、、絶句

ケーブルがあちこち結線で止められているうえに、3.5インチベイも侵食されとる

しかもIDE2コネクタが他のSATAのHDDやらケーブルに邪魔されていて全部ばらさないとセットできそうにありません。そもそも、DMAのディスクを入れるくらいなら新しくSATAのディスクを追加しようと決めていたんだから、バラしてまで装着する気はありません。

で、これだ。