Drkcore

14052011 chemoinformatics

The Evolution of Drug Discovery

Hugo Kubiny著だったら買うしかないじゃん！と思ったらはしがき要員だった。

The Evolution of Drug Discovery: From Traditional Medicines to Modern Drugs
Enrique Ravina
Wiley-VCH / 7344円 ( 2011-05-16 )

目次をみたけど、ケミスト向けの本かも。

14052011 life

経済成長の必要性

小難しい言い回しも多いが、なかなか面白かった。終章は飽きたので読んでない。

経済成長って何で必要なんだろう? (SYNODOS READINGS)
芹沢一也
光文社 / 1050円 ( 2009-06-25 )

学習だとか、世界のどこかで新しい技術が生まれ出てくることが、平均すると一人当たり生産額を2.5%ぐらいは増やしている。ですから、売れる量が変わらないなら、黙っていても人手が少なくて済むことになります。

これはそうだよな。

ある水準に達した国の最大の問題は、何をしたらいいのかわからないということです。

これは知の高速道路という表現がされることもありますな。

ウェブ時代をゆく ─いかに働き、いかに学ぶか (ちくま新書)
梅田望夫
筑摩書房 / 777円 ( 2007-11-06 )

医療保険だって国民健康保険と社会保険という二つの仕組みがある事自体が不自然ですよね。年金もそうで、要は払っている人しかもらえない福祉です。そんな福祉が、はたして福祉と呼べるのか、それは金融商品じゃないのか

そう言われるとそういう気がするなぁ。破綻は確実だしなぁ、商品だったら払わないという選択をしても構わないのではなかろうかね。

経済政策というのは、必然的に再配分をともなうわけです。僕が問題にしているのは、現在の日本では、貧乏人の若者からとって金持ちの年寄りに配る結果になっている。この状況を動かすには、インフレや引退世代に税金を課すという案になるのですが、それを受け入れてくれる勢力がほとんどない。

相続税を100%にすればいいんじゃない？と個人的には思う。

CSRがずいぶんもてはやされているが、企業は法令さえ守っていればそれ以上の社会的な責任を負う必要はないと考えている。営利企業は彼らがもっとも得意とする活動、つまり営利に資産を集中すべき

これは斬新。CSRが重視されるようになった経緯をよく考えてみる必要はあるな。

負の所得税

ベーシック・インカム的にはこういうほうがスマートだよなと思っている。

社会保障の徴収は、免除のケースを除くと固定額の部分が大きい。ということは所得が低い人ほどこれを払うのはきつい。これは典型的な「貧乏な若者から金持ちのお年寄りへの再配分」です。もちろん、政治的にはこれはタブーに近いでしょうね。

世代間闘争で負けるのでこれはそうだろうな。じゃぁいつやめるかっていう議論があってもいいと思うんだけどなぁ。

13052011 bioinformatics Python

pubmedのidをdoiに変換する

pubmedのidからdoiを調べたい。

BeautifulSoupでXMLをパースするのが良いのだが、ソース見たらげんなりした(preってなんやねん)。というわけで、MEDLINE形式のデータから正規表現でdoiを抜き出してます。

#!/usr/bin/env python

import urllib2
import re,sys

def pmid2doi(pmid):
   url = "http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/%s?dopt=MEDLINE" % pmid
   r = re.compile('AID - (10.\d+/.+?) \[doi\]')
   response = urllib2.urlopen(url)
   if response.code == 200:
       s = response.read()
       m = r.search(s)
       return m.group(1)
   else:
       return "error: %d" % response.code

if __name__ == '__main__':
   if len(sys.argv) == 2:
       print pmid2doi(sys.argv[1])
   else:
       print "usage: %s [pmid]" % sys.argv[0]

コマンドラインから使う場合には

$ pmid2doi.py 20053000
10.1021/ci900416a

Bioinformatics Programming Using Python
Mitchell L. Model
Oreilly & Associates Inc / 5119円 ( 2009-12-23 )

12052011 ramen 富士

大山で油そば

冷やし大坦麺が出る季節なので大山に。

僕は油そばが気になっていたのでそちらをチョイス

1305202224

妻の頼んだ冷やし大坦麺は相変わらずの美味さ。右下の方に見える氷みたいなものは、ずばり氷です。

1305202221

最近、子ども二人が食べまくるのでミニカレーも注文

1305202226

そろそろラーメンをもう一つ頼んで二人で分けないとたりないかもしれん

ラーメンマップ静岡
高橋秀人
幹書房 / 1050円 ( 2008-10-15 )

ラーメンマップ静岡2

幹書房 / 1050円 ( 2010-11-02 )

12052011 work life

成果主義がそもそもうまく機能しないのはなぜか

モチベーション3.0を読んであれば理解しやすい。本書では日本人のやる気がないのはモチベーションの認識がきちんとできてないことと、そういうマネジメントがきちんとできる管理者がいない（または質が低い）ことに問題があるとしている。

成果主義は「馬の目の前に人参をぶら下げる制度」だが、現実には、モノやお小遣いで動機づけられた子どもがやる気を出すケースは稀

ま、そういうマネジメントは年功序列で持ち上げられた管理者には難しいでしょうねー(棒読みな感じで)。さらに研究職系のだと技術もないからロールモデルにすらならんし。

そもそも部下の評価などあまりしてこなかった管理職が、ひとりひとりの部下に適切な目標を立てさせて、その達成を手助けし、さらにその達成度を適正に評価するのは並大抵のことではないはずです

世界でいちばんやる気がないのは日本人――成果主義が破壊した「ジャパン・アズ・No.1」 (講談社プラスアルファ新書)
可兒鈴一郎
講談社 / 840円 ( 2008-06-20 )

日本人が極端にやる気をなくしたひとつの原因として「管理職の質の問題」が挙げられます
いまや「成果主義はうまくいったのかどうか」ではなく、「いったい成果主義のどこに問題があるのか」に世間の関心は移ってきている
デビルズアドボケイト
先進十カ国のなかでは、日本の管理職のレベルはかなり下。行動科学をしらないから。
日本人は何に対して給料を貰っているかという意識が希薄

会社の制度の話について知りたいのなら面白いけど、モチベーションをどうやってあげたらいいかなぁという話に関してはモチベーション3.0のほうがいいと思いますね。

モチベーション3．0　持続する「やる気！」をいかに引き出すか
ダニエル・ピンク
講談社 / 1890円 ( 2010-07-07 )

デビルズアドボケイトやると、結構怒り狂うヒトがいるのでロジカルじゃない研究者は結構困るというか逆にスクリーニングの手段として有効。そういうヒトはデスマりやすいので、普段から危険には近づかないように気をつける。

11052011 Python Flask Sphinx GAE

jQuery Form Pluginを使えば簡単にAjaxなformを導入できる

今、欲しい物はこういうモノです。

Real World Haskellのように、文書のパラグラフ毎にコメントが入れられるようなシステム。それをSphinxでやりたい。つまりSphinxで文書を書いてmake htmlをするとパラグラフ毎にtwitterのOAuthかGoogleの認証使ってコメントが入れられるようなHTMLが出力されるナイスなドキュメント

実際にReal World Haskellのソースを追いかけてみると、jQuery Form Pluginを使っていてAjax化が簡単にできそうなので、別の題材で試してみる。もちろんflaskr

statisticsにjqueryとjquery.form.jsを配置
show_entries.htmlのformにid属性をつける(id='flaskr_form'っていう属性をつけた)
layout.htmlにjsの設定を追加

layout.html

<script type="text/javascript" src="{{ url_for('static', filename='jquery-1.6.min.js') }}"></script> 
<script type="text/javascript" src="{{ url_for('static', filename='jquery.form.js') }}"></script> 
<script type="text/javascript"> 
        // wait for the DOM to be loaded 
        $(document).ready(function() { 
            // bind 'myForm' and provide a simple callback function 
            $('#flaskr_form').ajaxForm(function() { 
            $(document.body).load("/");
                alert("Thank you for your comment!"); 
            }); 
        }); 
    </script>