ChEMBL23導入備忘録

ChEMBL 23がリリースされたのでMBAに入れておこうかなとしたら、psqlがreadline絡みのエラーで壊れていたのでpostgresを再インストールした。それからchemblのダンプファイルのrestoreのやり方がちょっと変更になっていたので備忘録

postgresqlをbrewで入れ直す

最後の三行は適当。--forceで警告が出たから打ってみた。

brew uninstall postgres
brew install postgres
brew link postgres --force
brew unlink postgresql
brew link --overwrite postgresql

ChEMBL23をpostgresに入れる

ダンプファイルをダウンロードしたら解凍して

createdb chembl_23
psql -l
pg_restore -d chembl_23 chembl_23_postgresql.dmp

こんな感じで更新できた。

ProductName We Are Virtual
Xilent
Audioporn Records / ?円 ( 2015-10-16 )


Mishima.syk #10やります

次回の日程は7/8(sat)に決定しました。参加登録は以下からお願いします。

2回程ハンズオンが続いたので、今回は発表メインでいこうかと思います。思う存分ネタをぶっ込んで下さい。

僕はpymol関連の話かpygamessをRDKitに対応させた話とかそんなのを出来ればいいなと思っているけど、どっちもまだ実装途中なんだよなぁ。

Splatoon2予約した

やるかどうかはわからんけど。ターゲットユーザーは息子と娘ですw

ProductName Splatoon 2 (スプラトゥーン2)

任天堂 / 6458円 ( 2017-07-21 )


microSDも用意しておいたほうがいいんだろうか

Amazonのサイト見てたのでついでに機械学習の本もポチってしまった

redmine.tokyoに参加してきました

最近自分でやっている勉強会にしか参加してなかったので、久しぶり。

そしてなにげにredmine.tokyoは初めてでした。

色々参考になったけど、個人的に気になったのは

  • mroongaで検索するってことはチケットに知識が溜まっているからだと思うんだけど、それってstack overflowクローンみたいなシステムに落とさないのかな?
  • backlogsプラグイン使っているとチケットにコメント入れないと思うんだけどそういう場合どこに知識を貯めるんだろうか?

ってあたりでした。redmineってあんまりスクラム開発には向いてないよねーって思いました。

次の日はカーンケバブビリヤニですよ。ビリヤニの美味しさはわかっているので今回ニハリにしてみた。

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レモンの酸味は慣れが必要だと思った。あと量が多いので今回はちょっと油断した。

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次回はビリヤニを堪能する予定。

なお、グミマロのブランドが終了していた。

やごみで打ち合わせ

久々にやごみで。

真鯛とホタルイカ

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ネギトロ

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尚、次回の勉強会は7/8(sat)の予定です。会場押さえてconpassの用意が出来たらまたアナウンスします。 今回はテーマは特に決まってないので好きなことを喋る会になるかもしれません。

GWあたりの出来事

今年のGWはMBAも壊れてたし車も足回りが調子悪かったりして遠出する気が全くおきなかった。そのうえ、娘がヒッキーのネット三昧という堕落生活を希望したので後半はなんか酒飲んでたら次の日になっているというループを繰り返してよかった。

まぁ働きすぎで疲れていたのでいいリフレッシュにはなったかな。GWあたりの活動ログ

富士宮の買い物に行ったついでに富士宮の蕎麦屋に行った。ちょっと名前を失念したけど美味しかった。 オススメ。名前は忘れたけどw

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連休明け朝一に会議が入ったため、急遽1,2に出勤することになり、やさぐれた面子で焼肉に癒やしをというか燻しを求めにいった。まぁあそこですw 尚、爆裂に食したというか飲んだというかマジ~でという金額だった。若さやばい。

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で3日は電車に乗って沼津からの昼タップルームでまったり。メニューが懐かしのアイテム揃いでよかった。

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早くあの頃のメニューにもどってくんないかなー。ビール美味しいのに安居酒屋みたいなメニューは勘弁みたいな感じに なってしまっていて、久しぶりにフード頼んだんじゃないかなぁ。

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4日は西の方に旅立った。朝ラー行けるかなーと思ったけど無理っぽかった(13時閉店の店が多い)ので 静岡で途中下車して中村屋で親子丼食べてからブラブラと島田へ

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五和の駅内カオスだったわ。尚、五和の居酒屋っていったら一軒しかないけど、SL見られるし、お酒も超ウマイので 16時の開店で凸して18時くらいの電車で帰ると普通に帰ってこれます。大井川鉄道の電車の本数ないから注意しないとヤバイことになるけど。

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6日は冷蔵庫に大根があったので、大根、ネギ、油揚げでカレーを作った。鶏肉と見栄えの悪いトマトも消費したかったのでヨーグルトに漬けておいて後から投入した。

根菜はカレーに合うのでマジオススメですね。じゃがいもなんてグズグズになってドロっとするから不要。

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よくある人参、玉ねぎじゃがいも云々のレシピはステレオタイプすぎると思うので、もっと自由にカレーを作れるようになると楽しいというか冷蔵庫の整理に役立ちますな。

最終日はシュウマイ作ったけど、いつも通りなので写真はなし。

それから、ぬか床をメンテし始めたのが去年のGWでちょうど1年続いたので自分を褒めたい。最近キュウリがでてきて楽しいですね。そろそろズッキーニとかそら豆なんかも漬けられるので楽しみが増えた。

2代目MBA(Macbook Air)

3週間くらい前にMBAが故障したので、ノートなし生活を送っていたのだけど、流石に耐えられないのでMBAを買いました。

SSDを換装したときの要領でSSDを取り出して、新しい方のMBAにデータを移行できたので復旧作業は簡単だった。これが心理的なハードルだったので安心した。

もともとのSSD(256GB)用にUSB変換アダプターがほしいんだけどMBA2012専用じゃないと駄目っぽいのでちょうどいいのがなくて困っている。trancendのケースだけ売ってないかな

秋葉館でしか見つけられなかったけど256のSSDの体裁を整えるために5Kはコスパ的にどうなんだろう?

「知識管理システムを導入したい」ではうまくいかないのでは?

知識管理システムを導入するだけで全て上手くいくと思っているヒトが多いなぁと。そういうヒト達は「自分たちにはITスキルがないからソフトの導入が出来ない」と言い訳するのもステレオタイプな気がする。

そもそも真の課題は「システムの助けを借りて知識管理する文化を醸成したい」というのが正しい認識だと思うのだが、上記の人達は文化醸成のための努力をする気が全く無いので、ソフトの導入がゴールになってしまい結局うまくいかないのかなぁと思う。

で、うまくいかないのをソフトのせいにして、別のソフトを導入すれば今度こそうまくいくかもとまた夢をみてしまうという負の連鎖が起きているのではないだろうか?

華音で昼酒やってたので行ってきた

静岡に行ってきた。

で、華音が昼酒始めてたので寄ってみた。

ホタルイカ、よっぱらい鶏

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ピータン豆腐とうなぎの肝のチリ炒め

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お燗と中華でまったりしてきた。

ひなよしで飲んだ

前の職場の同僚という後輩が近所に転職するので、同僚とその転職先知り合いとひなよしで飲んできました。

ちょっとここでは書けないけどどこも困っているんだなぁっていう話とか色々できて楽しかった。 尚、今回は静岡出張無しで帰宅した。

お通し。お酒は一升瓶から注いでくれます。升にこぼして戻すスタイルは賛否両論あるかと思う。

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あんきもと造りの盛り合わせ

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のどぐろは美味しかった

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そういえば、今の会社の謎メール文化を伝搬させようと出向いたんだけど、ひなよし着いた瞬間にそのこと忘れてしまった。

  • 「謎のスラッシュルール」と転職組に命名されているメール仕様(尚、暗黙w)
  • メールのCcに自分のメールアドレスを入れる風習(たまにうざくてメールを即消すらしいw)
  • フラグを立てずに【重要】とか【読み飛ばし禁止】とか書いてある