Drkcore

05032007 Python java

jythonが2.2betaになってた

ここのところ更新がなかったので、もしかして終わっちゃったのかなと思っていたjythonが2.2betaになってた。

The Jython Projectから早速ダウンロードしてインストール。

これでpythonからjavaのライブラリが使えるが、ケモインフォ的にはCDKとdatasetをいじったりとか。あとRなんかで色々出来る気がする。

あと、QSAR用のレポジトリ欲しいナァ。論文に投稿するんだったら、sdfと活性値をsubmitしないと駄目みたいなPDBっぽい約束事とかあれば、いいと思うんだけど。再利用性が悪くてかなわん。

04032007 Python

ふじやでうな重

芝川になかなか美味い鰻屋があるというので行ってみた。

外見はなんの変哲もない(というかこれでやってるのか?)と思わせるような店構えなんだけど、うな重食べたら、なかなか旨くてびっくりした。

鰻の香りが良い。タレはやや濃い目だけど、甘すぎずよい。富士宮あたりの鰻屋で美味しい所に当たったことがないので、なかなか満足した。

今昔,京,ふじやといいこのあたりの店は美味しいところが多いナァ。

あ、平七っていう蕎麦屋いってないわ。今度いこう。

02032007 Python

scipy+matplotlib+ipython

綺麗なグラフが描きたいのでmatplotlibを触ってみたりしている。あとdensity plotとかも描きたいのでscipyとかチョコチョコ入れてみたり。対話的に処理すんならipythonがええよって書いてあったので、使ってみてるけどまだよさがわかってない。もう少し使ってみないと。

で、明日はU隊長の実家に行くので、今は携帯用のレッツノートにcpanminiのアップデートをしている。あとはpython関係も全部入れてドキュメントのpdfもusbメモリに入れといた。あそこは田舎すぎてネットにつながらん(携帯もソフトバンクは不可)ので。

svkも入れときゃよかった。

こんな感じで、いつも集中して開発するぞとか思って旅立つんだけど、結局酒呑んで酔いどれてんだよなぁ。

ヨコゼキ侮れん！

てか、ヨコゼキ最高!あの巨大冷蔵庫に入るとワクワクすんね。

02032007 静岡

一匹の鯨

伊豆長岡駅そばの一匹の鯨。ラーメン食うぞ！－静岡東部版－みて気になったので行ってきた。

ネーミングのせいかわからんが、ちょっとメニュー構成を把握するのに時間がかかった（そのせいで店員さんをちょっと待たせてしまった。）

座敷もあって子連れにもやさしい。

オーダーしたのはあっさりの太麺(左)とU隊長の頼んだ細麺(右)。太麺は鶏系、細麺は魚介系。

ちょっと塩味がきつかったので、スープの絡む細麺は最後のほうきつそうだったかな。太麺が正解かも。最後まで飽きなかったし。

次寄ることがあったら、三つ割り菊行くかどうか悩むナァ（こっちは蕎麦だけど）。

01032007 perl

今更ながらライブドアに一発クリップのショートカットがあることを知った

設定いじってたらうっかり見つけた。早速iってショートカットを使えるようにしてIPC（イッパツクリップ）ってタグ振るようにした。

が、クリップのレートのとこにRSSフィードのレートが入ってしまうのが気になる。このクリップのレートはどういう風に使うんじゃろか？

さらに、クリップブラウザってのも発見した。ちょっと前にクリップしたエントリをもういちど見たいって場合には便利かな。1画面分(40件)までだったらこれで探すかも。それより前のクリップだったらタグかなぁ。

で、ふと考えたのが、

超整理法みたいな時系列の並びの記憶はいつまで優勢で、どのくらい古い記憶になるとタグのほうが探しやすくなるんだろうか？

つまり情報の量と時系列的な検索とタグによる検索のバランスはどうなってるんだろうか？

最近たくさんのエントリをフロー読みするようになって、一昨日くらいのエントリもタグつけてないと探せんようになった（僕は）。情報の量が増えたから記憶の整理ができる時間軸のレンジが狭まったのか、覚える気がなくなったから、フロー読みができるようになったのか、、、うーんどうなんだろう？

01032007 itunes

論文情報ポッドキャスティング

錬金術師の苦悩 - ひさしぶりの投稿

最近は、いろいろなjounalでPodcastの配信を始めているので、通勤のお供や、英語の勉強に最適です。

Natureとか医学系論文はポッドキャストしてるんだ、、、、知らんかった。早速通勤で聴こう

J.C.I.Mとかもポッドキャスティングしてくれんかな。

01032007 designpattern デザパタ

Spiffyでテンプレートメソッドを書いてみた

Kwikiで使われているSpiffyが気になったのでテンプレートメソッドを書いてみた。

-Baseで継承すると、$self=shiftとパッケージの最後に1;をつけなくてもよくなるので、コード量が減るらしい

AbstractDisplay.pm

package AbstractDisplay;

use Spiffy -Base;

stub 'open';
stub 'print';
stub 'close';

sub display {
        $self->open;
        for my $i (0..4) {
                $self->print;
        }
        $self->close;
}

CharDisplay.pm

package CharDisplay;
use AbstractDisplay -Base;

sub new {
   my $char = shift;
   bless {ch => $char}, $self;
}

sub open {
   print "<<";
}

sub print {
   print "$self->{ch}";
}

sub close {
   print ">>\n";
}

StringDisplay.pm

package StringDisplay;
use AbstractDisplay -Base;

sub new {
   my $str = shift;
   my $w = length($str);
   bless {
       string => $str,
       width => $w
       }, $self;
}

sub open {
   $self->_printline;
}

sub print {
   print "|$self->{string}|\n";
}

sub close {
   $self->_printline;
}

sub _printline {
   print "+";
   for my $i (0..$self->{width}-1) {
       print "-";
   }
   print "+\n";
}

main.pl

#!/usr/bin/perl
use strict;

use CharDisplay;
use StringDisplay;

my $d1 = CharDisplay->new('H');
my $d2 = StringDisplay->new("Hello, World.");
my $d3 = StringDisplay->new("るるるるる");

$d1->display;
$d2->display;
$d3->display;

で実行してみる。

<<HHHHH>>
+-------------+
|Hello, World.|
|Hello, World.|
|Hello, World.|
|Hello, World.|
|Hello, World.|
+-------------+
+---------------+
|るるるるる|
|るるるるる|
|るるるるる|
|るるるるる|
|るるるるる|
+---------------+

抽象クラスのstubは実装をサブクラスに任すときに使う。サブクラスで実装されてないとdieする。

試しに、CharDisplayのprintメソッドがないと

Method print in package AbstractDisplay must be subclassed at \
/usr/lib/perl5/site_perl/5.8.8/Spiffy.pm line 279
        Spiffy::__ANON__('CharDisplay=HASH(0x9a49c28)') \
        called at AbstractDisplay.pm line 12
        AbstractDisplay::display('CharDisplay=HASH(0x9a49c28)') \
        called at ./main.pl line 11