Drkcore

31032007 bioinformatics turbogears

病理組織画像のflickrみたいなもんをつくる

ふと、毒性評価のチームが「病理とかの画像にタグつけて管理したいなぁ」とのたまうので、

ほう、それはイントラflickrクローンみたいなものに落書き機能をつけてタグとコメントで管理できる洒落たツールが欲しいということか？

それいいじゃん!ということでいけそうか試してみた。

Making a Flickr Killer With TurboGearsを参考に喜久酔ひっかけながらもそもそと手を動かすこと30分。

おーCRUDくらいまでできた。

tflickr

SQLiteのText型ってBLOB突っ込めんの知らんかったが、実際はバイナリはデータベースに突っ込むよりはファイル管理のほうがいいのかな。タグ付けは自分で書いてもいいし、Tastyにお任せしてもいい気がする。

落書き機能(病理画像に着目ポイントを書き込む機能)はAjaxかAS3でつくる。

gimpとかphotoshopのレイヤーみたいに重ねる感じにすればいいと思うんだけど。そのうち、まとまった時間をとってやる。

29032007 english

もっとえいご漬け来た

英語が苦手な大人のDSトレーニングもっとえいご漬け

任天堂 / 2891円 ( 2007-03-29 )

英語強化年間ということで。

28032007 bioinformatics

生物情報の相互運用性2007

行ってきた。何年か前の遺伝研での開催してたとき以来だけど、かなり充実してたので色々勉強になった。

構成的のまとめが素敵。

あとで考えてみよう。

SOAP,RESTの使い分け

ユーザー（解析者かちょっと使いたいだけのユーザーか）、処理時間（レスポンスどのくらい待てるか）で一度ちゃんと考えてみる。

あとsoaplabいじる

ワークフロー管理ツールのためのモジュールの単位

blastallのオプションでblastpとかblastnとかあるんじゃなくて、別のプログラムっちゅうかモジュールとして分けるべきとか、ワークフローに近いものを単位としてみせたほうがいいんじゃないのとか。これとかワークフロー自体を一つのモジュールにできるけどtavernaは入れ子にできるんだろうか?

28032007 audacity lame

Audacity+LameでレコードをMP3に

新しいレコードプレーヤーがきたので、これを機に録音環境も変えてみた。今までは、UA-3FXについていたSound It!3.0LEを使っていたんだけど、編集が若干制限されていたりしてちょっと使いにくかった。あまりこだわりがなかったから使い続けてたけど、折角なので、TTUSBに同梱されているというAudacityを触ってみることに。

MP3で保存するときについでにタグの編集ができるのでかなり便利かも。

25032007 music d'n'b

it's a jazz thing (Remix)

It's A Jazz ThingをUtah Jazz がRemix。

It's A Jazz Thing

ちょいと速く、そして重く、厚く。渋さはそのままノリアップって感じ。

iTunes漁ったらオリジナルはTotal Scienceに入ってた。

TOTAL SCIENCE V
オムニバス
MCAビクター / ?円 ( 1995-11-22 )

今聴いてもなかなかいいね、これは。

Jodeci - Feenin LTJ Bukem MixとかSkool Of Hard Knocks - Kan Ya Feel It,Wax Doctor - Never As Goodに★つけてた。

25032007 as3

はてな技術発表会(ASとか)

機能変更、お知らせなど - はてな技術発表会日記

やっぱこれからは Flash Da Yo Ne!(flash厨期)

おもしろかった。気になった事をメモっておく

EmacsのASモード

これとか。

;;AS3
(autoload 'actionscript-mode "actionscript-mode" "AScript" t)
(setq auto-mode-alist
      (cons
       '("\\.as$" . actionscript-mode) auto-mode-alist))

とやって動かしてみてる。

fcwrap

fcwrap便利そう。あとで試す。

ECMAなのにjavaぽい

javaっぽいのにECMAScriptとは。ここのあたりの理解がいまいちだな。もうすこしASいじってみてからちゃんと調べてみよう。

24032007 ffmpeg

ffmpegを使ってみた

仕事で1G位のmpegを渡されたのだけど、扱いにくいので急遽ffmpegでxvid圧縮したら100M位に圧縮されて嬉しかったので、家のサーバーにも入れることにした。

ここらへんを突っ込んだ

Video Codec
xvid
x264
Audio Codec
FAAC,FAAD
Ogg Vorbis
lame
a52

いくつかはまったのでメモ

x264は--enable-pthreads付きでconfigure
faadはここのを使う
faacのconfigure.inもおかしいのでなおす
ffmpegは--enable-x264 --enable-pthreadsがセット

Xactiを買ったこともあり、最近また動画で遊び始めているのだけど、いろいろ変換できる環境があると便利だし、変換してAfter effectsでいじれるのでソースが増えて楽しい。

あとAfterEffectsのexpressionってEcma scriptsなんで、ここらへん読んでも楽しいかも。

24032007 vi

viの技をひとつばかし習得した

基本的なことなんだろうけどDOSの改行コードをUnixのそれになおすには

:set notextmode

とやればいいらしい。

知らんかった。

07.03.24追記

viではなくてvimだった

24032007 vim vi

FC6のviはvim

にぽたん休憩所 - nkf の技

「vi の技」ってか、それ多分、vi じゃだめじゃないすかね。

僕の環境(FC6)は

$ which vi
alias vi='vim'
        /usr/bin/vim

だったんでunaliasして

$ which vi
/bin/vi

これでも:set notextmodeが効いたので、今のviは賢くなったよなとか感心したのだけど。

バージョンみてみたら

$ vi --version
VIM - Vi IMproved 7.0 (2006 May 7, compiled Feb  6 2007 07:53:39)

vimだった。

24032007 chemoinformatics

デスマーチの匂いがする

プロジェクトである限りデスマーチは必ず存在するわけで、ソフトウェア業界だけでなく創薬シーンにもデスマーチはもちろん存在する(そういう呼び方をするヒトが少ないだけで)

で、久々にデスマーチの強烈な香りがしたので、忙しく動きまわって足掻いてみたけど、、、、

デスマーチ

こうやって比喩的に書けば、「勇気をもっていったん立ち止まり、進むべき方向を見定めて方向転換すればいいのだ」と簡単に言えるでしょう。しかし実際にはこれはなかなか難しいことです。「いったん立ち止まる」とは、締切が差し迫ったプロジェクトで開発をストップすることですし、方向転換とは今まで進んだ分を放り出して違う方向へ進むことだからです。常に後から追い立てられている状況でそれができるでしょうか？なかなかできることではありません。

むーーーな感じ。というか尽きた。

デスマーチ第2版ソフトウエア開発プロジェクトはなぜ混乱するのか
エドワード・ヨードン
日経BP社 / 2310円 ( 2006-05-03 )