これ読んでブレークポイントの使い方がわかってデバッグが楽になった気がする。

Perl Debugger (Pocket Reference (O'Reilly))
Richard Foley
Oreilly & Associates Inc / 882円 ( 2004-01 )

Devel::Baysideで公開されてる資料もわかりやすくてよいですな。

LLのお昼はカレーにするとか言ってたが暑すぎなので麺者服部のつけ麺にしてしまった。

つけ麺(普通盛り)で正解。LLセッションでお腹いっぱいだったしな。

pythonにはperlでいうところの__END__みたいなもんはないんか？っていうスレッドを見ていて、MeadowにM-x comment-regionっていうのがあるのを知った。

いままでdmacro.elでちまちまやってた。

さらにキーバインドを設定すればもっと快適だ。

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早速購読。

PerlMolにはseparateメソッドがあるので、SMARTSで適当にマッチさせて結合を壊してからseparateすると化合物の構造を分割できる。

芳香環の炭素原子とヘテロ原子の間を切って、分割した構造をsmilesで出力するスクリプトはこう書ける。

use warnings;
use strict;
use Chemistry::File::SMARTS;
use Chemistry::File::SMILES;
use Chemistry::Ring 'aromatize_mol';

my $SMILES = shift;
my $react = Chemistry::Mol->parse($SMILES, format => 'smiles');
my $SMARTS = 'c-A';
my $pattern = Chemistry::Pattern->parse($SMARTS, format => 'smarts');

aromatize_mol($react);
molsplit($react);

sub molsplit {
 my $mol = shift;

 if($pattern->match($mol)){
   my @nbd = $pattern->bond_map;
   my @nfg = $pattern->atom_map;

   $nbd[0]->delete;
   for my $fg (@nfg){
     my $hcnt = $fg->implicit_hydrogens();
     $fg->implicit_hydrogens(++$hcnt);
   }

   for my $frag ($mol->separate){
     molsplit($frag);
   }
 }else{
   print $mol->print(format => 'smiles', unique => 1, name => 1),"\n";
 }
}

試しにpioglitazoneを分割してみると

$ perl molsplit.pl "CCC1=CN=C(C=C1)CCOC2=CC=C(C=C2)CC3C(=O)NC(=O)S3"
CC      
c1ccncc1        
CCO     
c1ccccc1        
CC1SC(=O)NC1=O

一緒に仕事をやっている後輩(みたいな関係)に上司にどこまできちんと報告したらいいんですかね～

と聞かれたので、やる気レスな僕がとっさに答えたヨ。

• わからせるのがベスト
• わかった気にさせるのがベター
• 報告したという事実を残すのがマスト

といいつつ、ここ何年かは常にベター狙いの僕がベスト狙っとけとか言うのもおこがましいんだけど。

でも、わかった気にさせるようなプレゼン資料をつくんのも結構楽しいヨ。そのレベルまで降りてってツボついてジャストミートさせなあかんからね。あと僕に割と欠け気味な他人の自尊心を煽るという訓練になるし。

章ってのは読了になるのだろうか?

計算機プログラムの構造と解釈
ジェラルド・ジェイ サスマン,ジュリー サスマン,ハロルド エイブルソン
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それにしてもやっとって感じ。

沼津にあるベアードビールからビールの詰め合わせが届いた。

が、風邪ひいてて鼻づまり+喉が痛いの現状だと飲んでも美味しくないんだろうなぁ

ちっとラーメンでもと、自転車こいで街にでてみたのはいいけど暑すぎ。途中でラーメン食べる気がなくなってしまい、急遽蕎麦。三島のブックオフの向かいにある石臼引きの手打ち蕎麦の店にはいった。

ここは、開店当初に一度行ったことがあるのだけど、そのときは切りがいまいちだった(揃ってないし、太かった)のでそれ以来特に行ってなかったんだけど、あれから3年くらいはたってるしなぁ。と期待半分で。

大関という大き目のざるを注文。

蕎麦はなかなかよかった。ちょっと蕎麦がぬるいのが気になったくらいだけど、外が暑かったから蕎麦に冷たさを求めたんでしょう。あと辛汁はなんかもさっとした感じだったのが印象に残った。