13042008 chemoinformatics bioinformatics wii
ずいぶん前に加速度センサでPyMolを動かしてみたことがあるんだけど、案の定、
細かい制御が出来ないから使えねーよな、プレゼンだったら別にいいんだけどよ
みたいなコメントが入っていて、やっぱワイヤレスなセンサーバーが欲しいなあと買ってしまった。
これで、PyMolいじりだ。今回使用したMoleculeはMolecule of the MonthにのっていたAdrenergic Receptorsだ。ちなみに、僕はTopoisomerasesとかが気に入っているが。
IRセンサーのほうが位置を決めやすいので動かすのがやっぱ楽チン。
IRセンサーと加速度センサーの入力を取りたいだけだったらbluetoothでやりとりできるWiiコントローラのほうがGainerよりも楽だな。
13042008 jython processing
list 3-4-aをjythonで。
書いたコード。
Wii用ワイヤレスセンサーバー『ワイヤレスセンサーバーW』from javax.swing import JFrame
from processing.core import PApplet
class Sketch(PApplet):
def __init__(self):
pass
def getField(self, name):
return self.class.superclass.getDeclaredField(name).get(self)
def setup(self):
self.size(800, 600)
self.colorMode(PApplet.HSB, self.width)
self.background(self.width-1)
self.noStroke()
self.frameRate(10)
def draw(self):
self.fill(self.mouseX, self.width*0.5, self.width-1)
self.ellipse(self.mouseX, self.mouseY, self.mouseY/2, self.mouseY/2)
def run(applet):
frame = JFrame(title="Processing",
resizable = 1,
defaultCloseOperation=JFrame.EXIT_ON_CLOSE)
frame.contentPane.add(applet)
applet.init()
frame.pack()
frame.visible = 1
if __name__ == '__main__':
run(Sketch())
なんとなく今日も読んでいる。
Catalyst: Accelerating Perl Web Application Development6章はファイルシステムをCatalystのモデルにするサンプルだが、Catalyst::Model::Adaptorを知ってしまうとあまりそそられなかった。
7章はJemplateが楽しそうなんだけど、ググっても、実際に使われているという例が出てこないのが気になった。なんかデメリットでもあるんだろうか?
Catalystのモデルを書くの面倒だなーと思っていて、Catalyst::Model::LastFMがあると便利な気がしてたんだけど、微妙に放置してた。
が、Catalyst::Model::Adaptorを使ってみたをみて、コレだーって思った。
$ script/drkcore_create.pl model LastFM Adaptor WebService::Audioscrobbler new
とやるだけで、WebService::AudioscrobblerがCatalystのモデルになる。らくちんだ。
last.fmのチャートを表示するようにしてみた。
おーblur意外に聴いてんな。On The Way To The Clubヘビーローテしてたからかな。
久しぶりに。
Catalyst: Accelerating Perl Web Application Development中里の大山
二つほど新発見。
ユーストアとなりのエイデンという電器屋のおもちゃ売り場がヤバイ。電子工作に使えそうなIRのヘリとかラジコンがいっぱいあった。
大山の隣の、ゲーセンの恐竜コイン落しでやられた。隣のおっさんはあほほど勝ってたけど、楽しんでる顔じゃなかったな。
08042008 life
パラパラめくって以来なんもやってない。
これはいかんと、お小遣いゲット後に欲しい本を貼り付けてやる気を引き出すメソッドを実践してみることにした。
Programming Collective Intelligence: Building Smart Web 2.0 Applicationsあーやる気出てきたかも。
08042008 chemoinformatics bioinformatics
PDBWikiというのが立ち上がったらしい。どういうアノテーションが溜まっていくのか興味あり。
とか書いてたら、MDとかMOとかのアノテーションがついた結晶構造のデータベースがあってもいいじゃないかと思った。PDBのデータを見ていて思うのはインタラクションに関するデータがないのがアレかなと思ってたりするので。リガンドとたんぱく質の相互作用に関する知識を深めていけるような何かがあればいいなぁ。
PDB-631Gプロジェクトとかそんなかんじの。
またはMolecule of the Month みたいな感じで、Interaction of the Monthとか。
Think Tank
Learning OpenCV
Visualizing Data
jQuery in Action
ワールド ワールド ワールド
TRUST