渋い。ディープっていうかトランシーというか。

Editing Shadows
Sei A
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ミニマルっぽいのが良かった。

本日休みで、息子が寝ている間に自分の部屋のレイアウトをちょっと変更して、macbookをすぐにレコードから録音できるような状態にした。そして、引越しの時に詰めて以来二年以上放っておいたレコードの段ボール箱を漁った。

今は亡きシスコの段ボール箱。ドラムンベースが7割位。あとミニマルテクノ。ハウス少なめ。

これはボアダムスかな。

glrの010(pfm)とかharthouseの初期〜中期のやつ(hardfloorとかalter ego)を聴いて喜んでた。

今日は子守で会社を休んでいるのでPRMLのサンプリングの章でもじっくり読んでやるかという有意義そうな予定を組んでいたのだけど、なぜかmacbookにblast入れたりしていた。

しかもportで入れたblastが古くてあれやなぁと。調べたら今時はBLAST+(ブラプラって読むの？)らしくて、Biopythonのほうも対応しているらしいのでこっち入れなあかんやろと、何が目的だっけ？そもそもblast入れる目的なんだっけ的なよくあるパターンに。

NCBIのダウンロードサイトからMac OSX用のをダウンロードすればよい。

/usr/loca/ncbi/binにインストールされるのでパスを切っておく。

コマンドは引数も含めていろいろ変更されていて、blastallのpオプションで指定していたのがそのままコマンドになっている。formatdbがmakeblastdbになっていたりとか。

引数も短縮形じゃなくて、意味がわかるようなものに変更されている。

blastp -query test.fasta -db pdbaa

あと、ホームディレクトリでblast実行すると以下のエラーが出るんだけど、最初どこに問題があるんだかわからなかった。

  what():  NCBI C++ Exception:
    "/am/ncbiapdata/release/blast/src/2.2.23/IntelMAC-universal/c++/GCC401-
ReleaseMT--IntelMAC-universal/../src/objtools/blast/seqdb_reader
/seqdbimpl.cpp", line 412: Error: OID not found

Abort trap

で、dbのファイルを絶対パスで指定してやると解決した。

blastp -query test.fasta -db /Users/kzfm/blast/db/pdbaa

ただしデータベースが見つからないときのエラーは

BLAST Database error: No alias or index file found for protein database

こんなんだからなぁ。

なんなんだろうね。バグ？

Bioinformatics Programming Using Python
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何故か今年は理事長です。階ごとに役員もちまわるシステムで運用されているんだけど、僕の住んでいる階は消去法でツライ職しか残されてなかったという。まぁ、最近の不景気でマンション内の状況がどうなってんのか（どうなりそうなのか？）とか興味があったのでいいかなと。

実際に理事会の役になったら色々興味が出てきたので読んでみようかと。

闘う楽しむマンション管理 (文春新書 654)
水澤 潤
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在庫あり。

リゾートマンションの話なので、完全に参考になるわけではないが面白かった。

• 自主管理は常に脆弱性を晒しているシステム
• 高圧季節別時間帯別電力という料金体系がある。
  • 高圧電力の料金体系は結構あくどい
• 原始規約は重要

マンションというのは基本的に家庭ごとに独立しているので、住んでいても全体がどうななっているかは結構わからないもんです。でも、集合住宅的な共用の部分とかはマンションの性格がでるかな？（と買ってから思った）

特に財政的なものは、どの頻度で売りに出てるのかとか、どの階の部屋がとか、相場と比べてどうかとかの中期的なデータで把握出来るかなと。

そんなこつこつみるのは自分の住んでるマンションとその近所くらいだけど、自分の住んでるマンションは因果というかそういうあたりが分かったりするので仮説検証にちょうどいい題材だったりする。

僕はジャグリング派なのだけど。

天秤のアナロジー使う人が多くて、結局何を暗示したいのか理解に苦しむことがある。

例えば、こんなのだと、「家族と遠く離れて単身赴任でもすれば、少ない家庭の絆とオーバーワークが釣り合うよ」とも受け取れるよね。

家庭と仕事の重さを支える支柱の強度を強くするということが何のアナロジーかよくわからんし、

支点を動かすのも何を意味するか分からない。

天秤でうまいこと説明しているサイトはないものか。

ドッキングシミュレーション

というシュールなネタを思いついた。

参考

• paper child

本日は地域の集まりがあったのだけど、道が空いていて思ったよりも早く集会所に付きそうだったので、近所にあるマイアロットメントガーデン(家庭菜園)で肥料を撒いてきた。

明日の早朝を予定してたので良かった。雨でも降って車に肥料積みっぱなしになると、車内が鶏糞臭くなってげんなりするからな。

家に帰ってからは、娘と一緒にゴーヤの種を水に浸すというタスクをこなしてみた。発芽率が低いらしいので多めに投入してみたが、沢山芽が出たらベランダでも育てるかな。

今年は唐辛子をわんさか育てて自家製辣油を作ってみたいんだけど反対されるんだろうなぁ。

ガベコレのやつとeffective java

ガベージコレクションのアルゴリズムと実装
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来週からPRMLの下巻を読み始める予定

パターン認識と機械学習 下 - ベイズ理論による統計的予測
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先月結婚した親戚にイタリアンロールと杉錦を送ったら、蕎麦が送られてきた。

この細さはヤバイ。茹で時間25秒。かつ流水にさらすと切れるので溜めておいた冷水で泳がす感じで。

僕ももう少し定期的に蕎麦打ちしなきゃな

と思った。

若干引っかかる感じはあるが、燗つけて呑んだらイケる。チェイサー必須かな。

一緒に写せといつもうるさい娘。

あと、酒造りの技法ももう少しきちんと理解せなあかんな。