pipが挙動不審に陥り、色々いじっていたらスパゲッテイを更にスパゲッティ度アップさせてしまい、ちょっとゲンナリしたので、イチから出直すことにした。
このサイトを参考にして
cd `brew --prefix` rm -rf Cellar brew prune rm -rf .git rm -rf ~/Library/Caches/Homebrew rm -rf ~/Library/Logs/Homebrew rm -rf /Library/Caches/Homebrew rm -rf Library/Homebrew/
と、綺麗にする。あとはHomebrewのサイトの指示に従う。