24 10 2012 chemoinformatics work Tweet
redmineはGitのようなVCSをセットにして使うのが当たり前なので、創薬系でもそのようなバージョン管理システムがあればいいなぁと思っている。
現状の化合物管理データベースは履歴管理をしないし、コミットログに対応するものも記録できないので、単なる構造データ管理としてしか機能しないが、化合物管理データベースのフロントにwikiかそれをモディファイしてコミットログとか履歴管理に対応する機能をもたせたものを用意すればやりたいことができそうだ。さらにAPIを用意してcliのラッパーとかpython,rubyバインディングを用意すればredmineと連携させやすいだろう。
logでログとかコミットツリーが出て
$ chemit log commit C0000123 Author: ChemistA <XXXXX> Date: Sun Aug 19 10:05:53 2012 +0900 improve solubility commit C0000122 Author: ChemistB <YYYYY> Date: Sun Aug 19 10:04:58 2012 +0900 reduce clogp fixes #24 commit C0000121 Author: ChemistA <XXXXX> Date: Sat Feb 4 09:02:58 2012 +0900 代謝安定性を改善 fixes #23
それから
$ chemit diff C0000121 C000123
と打つと構造の差分とMCSが表示されようなものを作ってredmineと連携できれば素敵じゃないかなと思ったので、実証用のコードを書いてみようかな。
Redmineによるタスクマネジメント実践技法