コマンドラインでタンパク質のポケットを探索してくれる。
fpocket
論文によるとVoronoi tesselationをつかってalpha sphere detectionをやるみたい。
1R39に対して試してみた。
実行は
fpocket -f 1R39.pdb
と叩けば、ディレクトリが出来てPyMol,VMD用のファイルが出力される。
