Drkcore

02 10 2006 perl Tweet

WWW::Searchのプロキシー設定

プロキシーサーバーの設定は

$search->http_proxy(['http','ftp'] => 'http://proxy:port');

で。$search->env_proxyはなぜかだめ。

ここらへんのモジュールを使って、P450 Tableから、CYPの基質とか阻害剤の情報取ってきて、DrugBankの構造情報とつなげてみた。

いきなり、P450 TableはDOMれず、躓く。しょうがないので、正規表現使って化合物名とinhibitorとかのクラス分類を抽出した。あとは、WWW::Search::DrugBank 使って、ほしいデータ(mol)をサーチしてつなげれば完了とか思ったんだけど、WWW::Search::DrugBankってIDでしか検索できない。うーん。

結局、webからサーチかます(これも色々ヒットしてきて精度悪くないか?)サブルーチン用意して、IDゲットしてからWWW::Search::DrugBank使って欲しいデータ取ってきた。

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