Drkcore

08 02 2006 bioinformatics publosxom Tweet

ChemDB

ChemDBはDBMSにポスグレつかってるらしい。他のDBとの比較があったので眺めたが、アノテーションの多さが売りのデータベースって感じかな。

ちなみに、マシンラーニング用のデータセット が遊ぶにはいい感じ。なんかいい記述子発生ソフトとかあればR使っていじってみたいところだが、オープンソースのdescriptorプロジェクトってあんのかな?ないのかな?サブストラクチャーベースのヤツだったらありそうな気もするけど。

あと、ChemDBで使われているOEChemのpythonライブラリが非常に気になったりしたヨ。そしてChEBIにはChemAxonの影が。

気になるといえば、第3回オープンバイオ研究会の「ビジュアライズの技法」というパネルセッションも気になる(さすがにいけないけど)。スライドとか公開されんのかな?

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