12012010 Ruby processing
ruby-processingのところのGalleryにあったA Face for Richie Hawtinはマイクの音に反応する。
椎名林檎の時は暴走するを流して適当にスクリーンショットを撮ってみた。
あとでコードをちゃんと見てみる。
12012010 Ruby
Rubyで作る奇妙なプログラミング言語
予約した
Rubyで作る奇妙なプログラミング言語 ~Esoteric Language~Quine
Esotericを読み始め。
一章の練習問題にファイルのオープンを使わないでQuine
printf a="printf a=%p,a",a
perlだとsigilが必要な分だけ難しいなぁ。
12012010 Ruby
Starry
12012010 Ruby
計算機プログラムの構造と解釈
実践Common Lisppylonsはじめました
pylonsはじめました。なかなか面白そうです。
とりあえず、getting startedとflickr search tutorialはやってみた。
catalystとかJiftyとかturbogearsとか(RoRもそうだっけか?)はとりあえずプロジェクトを用意して何も考えずサーバー起動してアクセスすると小洒落た画面がでてきて、おー！ってちょっとした感動を覚えたりするんだけどpylonsの場合はそういうのなしの方向で。
ただ、エラー吐かすとなんかすごいよ。エラーから入らせるとは、、、テストファースト？
QuickWiki Tutorialに続く、、、
12012010 chemoinformatics bioinformatics Python
python2.5でBioPythonを使う
python2.5に入れる場合はNumericがsourceforgeになかったり、MxTextToolsの古いバージョンを入れたりとか、いろいろとあれなので、ドキュメント読みましょうってことです。
で、RCSBからgz圧縮されたpdbファイルをとりにいってBioPythonで扱うサンプル
import urllib2, StringIO, gzip
from Bio.PDB.PDBParser import PDBParser
def fetch_pdb(id):
url = 'http://www.rcsb.org/pdb/files/%s.pdb.gz' % id
content = urllib2.urlopen(url).read()
sf = StringIO.StringIO(content)
return gzip.GzipFile(fileobj=sf)
if __name__ == "__main__":
p=PDBParser(PERMISSIVE=1)
s=p.get_structure("1bgw", fetch_pdb("1bgw"))
for model in s.get_list():
for chain in model.get_list():
for residue in chain.get_list():
if residue.has_id("CA"):
ca_atom=residue["CA"]
print ca_atom.get_coord()
ところで、製薬系のドラッグデザインっていうかchemoinformaticsなSoftwareはpythonで拡張できるものが多いんだけれども、その割にはpythonでガリガリ書くよっていうヒトはあんまし見かけたことないんですよね。
pylonsでQuickWIki
またwikiかよ、、、と敬遠しがちなWikiを作ろうチュートリアルだけど、フレームワーク自体はじめてのヒト向けには素直に書かないといけないし、幾つかのフレームワークを渡り歩いたヒトにも新たな発見とか他のフレームワークとの違いを見せるようなサンプルにしないといけないので、意外と構成を考えるのが難しいですな。
そういった意味ではpylonsでwikiを作ろうチュートリアルはdeleteの実装がajaxでのドラッグドロップになってて、しかも簡単に実装できる！っていう喜びが得られてナイスな感じ。
- modelまわり
- 他のパッケージの依存や自動インストールのやり方
- ルーティングの方法
- Ajax関連
ルーティング周りをちょっとよく理解していないのと、Ajaxがあっさり書けすぎてて何をやっているのかわからなかったので、あとでpylonsでなんか作ってみよう。