17052006 R Bioinformatics
文献あさってたらrecursive feature eliminationというSVMから記述子の重みを推定するらしき方法を見つけたのでRでできんもんかと探した。
結局探せなかったんだけど、Feature Selectionのためのツールを少し見つけたのでメモ。
Looking for packages to do Feature Selection and Classification
- random forest (varSelRF)
- caMassClass
あと、バイオインフォでもやっぱ使われてるのね。後で読もう
プリチャードの読学紀行 : Regularized Least Squares Cancer Classifiers from DNA microarray data
Classifier の中でもSVM とRegularized Least Squares (正則化最小二乗法)を比較した文献。 正則化最小二乗法はを使うことでSVMでの計算量の多さを低減し、未知のサンプルの遺伝子発現が少ない際に、その利点を発揮する、ということらしい。