Drkcore

17052006 R Bioinformatics

Recursive Feature Elimination

文献あさってたらrecursive feature eliminationというSVMから記述子の重みを推定するらしき方法を見つけたのでRでできんもんかと探した。

結局探せなかったんだけど、Feature Selectionのためのツールを少し見つけたのでメモ。

Looking for packages to do Feature Selection and Classification

  • random forest (varSelRF)
  • caMassClass

あと、バイオインフォでもやっぱ使われてるのね。後で読もう

プリチャードの読学紀行 : Regularized Least Squares Cancer Classifiers from DNA microarray data

Classifier の中でもSVM とRegularized Least Squares (正則化最小二乗法)を比較した文献。 正則化最小二乗法はを使うことでSVMでの計算量の多さを低減し、未知のサンプルの遺伝子発現が少ない際に、その利点を発揮する、ということらしい。

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