25 05 2017 chemoinformatics Tweet
ChEMBL 23がリリースされたのでMBAに入れておこうかなとしたら、psqlがreadline絡みのエラーで壊れていたのでpostgresを再インストールした。それからchemblのダンプファイルのrestoreのやり方がちょっと変更になっていたので備忘録
postgresqlをbrewで入れ直す
最後の三行は適当。--forceで警告が出たから打ってみた。
brew uninstall postgres brew install postgres brew link postgres --force brew unlink postgresql brew link --overwrite postgresql
ChEMBL23をpostgresに入れる
ダンプファイルをダウンロードしたら解凍して
createdb chembl_23 psql -l pg_restore -d chembl_23 chembl_23_postgresql.dmp
こんな感じで更新できた。