08 12 2016 chemoinformatics tensorflow Tweet
土曜のテスト用データになんかないかなーと探してたのだけど、ChEMBLのサイトではアッセイ数とかでフィルタリングができなかったので。
from pychembldb import * for assay in chembldb.query(Assay).all(): if assay.doc.journal == "J. Med. Chem.": act_num = len(assay.activities) if act_num > 100: print act_num, assay.chembl_id, assay.description
これだと効率が悪いのでものすごい時間かかるけど、一回流すだけだからまぁいいやと。