MLに流れてた。
app.routeでそれ用のを書く
@app.route("/favicon.ico") def favicon(): return app.send_static_file("favicon.ico")
または、メタ情報として書いとく
<link rel="shortcut icon" href="{{ url_for('.static',filename='favicon.ico') }}" />
自分で使うとしたら後者かな
追記 11.01.25
後者だとクローラーがやってきては404を残していくのでapp.routeで書いておくほうがいいかな