12 01 2010 chemoinformatics Python openbabel Tweet
Molblasterっていうのは化学構造をランダムに切断していくっていう試行を何度か繰り返す方法で、その後フラグメントの頻度をシャノンエントロピーで評価したりするらしい。
シャノンエントロピーのほうに興味があったのとちょっと簡単に実装できそうだったのでpython+openbabelでやってみた。
まぁでも、構造活性相関にもっていくんだったら普通はベイズの方にいくよなぁ。多分著者の論文あると思うんだけど調べてない。