08 04 2007 chemoinformatics Tweet
Open Babelが2.1にあがっていた。changelogを見てたら、MMベースの構造立ち上げが実装されていたが、どうも最近のことらしい。
というわけで、obminimizeというコマンドを使うと構造を立ち上げることができて、その後、mopacでちょこっと構造最適化をやってから、PyQuanteでエネルギー求めるとかいう事がLLでやれるようになるのでいい感じ。
08 04 2007 chemoinformatics Tweet
Open Babelが2.1にあがっていた。changelogを見てたら、MMベースの構造立ち上げが実装されていたが、どうも最近のことらしい。
というわけで、obminimizeというコマンドを使うと構造を立ち上げることができて、その後、mopacでちょこっと構造最適化をやってから、PyQuanteでエネルギー求めるとかいう事がLLでやれるようになるのでいい感じ。