BinaryQSAR絡みでいろいろ、ごちゃごちゃやったりしてたのだが、群わけだったらSVMデいいじゃん、とふと思った。
ので、ベイズとSVMの違いを調べたら、それっぽいのがスラッシュドットにあった。
スラッシュドット ジャパン | ベイズ推定で楽々スパムメールをフィルタリング
世間では,ベイズ分類器しか出回ってないようですが,なぜ SVM を使わないのだろう?やってみたけれど思わしくないのか,それともそもそもやってみていないのか。
ベイズだと
- 確率で出してくる(ので信頼性の目安にもなる?)
- 回帰モデルじゃない
- 回帰じゃないので計算速い
なんで、binaryQSARやるにはベイズはメリットあるのかな?
そしてRのコードも発見。★素敵★。
Binary QSAR is a non-linear modeling method that can be used to build models for binary categorical data (such as actives and inactives). It was described by Gao et al. (J. Chem. Inf. Comput. Sci., 1999, 39, 164-168) and Labute (Pacific Symposium on Biocomputing, 1999, 4, 444-455).