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03 07 2006 Haskell r Biohaskell Tweet

HaskellでBioinformatics

本日普通のHaskellプログラミングの7章まで読み終えた。そろそろ、具体的な例題解いてみたいなぁと思ったが、3部13章のWIkiをつくってみようの章まではあと5つもある。今のとこ、ここまで読んで、実用Perlプログラミングみたいに他の言語との違いみたいなページを割いてくれるとよかったりと思った。それ以外は、unixのコマンドをtailとかheadとかをhaskellで書こうみたいな感じにすすむので理解はしやすいヨ。

ProductName ふつうのHaskellプログラミング ふつうのプログラマのための関数型言語入門
青木 峰郎
ソフトバンククリエイティブ / ?円 ( 2006-06-01 )


実際に、どんな感じの問題に適用すんのがいいのかなぁとか、考えたときに、ゲノムみたいな大きい配列操作すんのに適してるも。もしかしてbioinformaticsでなんかあるかなと探したらあった。

  • http://www.ii.uib.no/~ketil/bioinformatics/
  • http://biowiki.org/BioHaskell

論文あったのでアブスト眺めたけど、DPってhaskell向きなのかな?まだ、いまいちわかってなさげ。

Rによる統計的プログラミング でRと比較しているのだから統計的な(というより数学的な)記述にむいているのは感覚的にわかるんだけどなぁ。

ということはchemoinformaticsでの利用例あるだろ、とか思うんだが見当たらない。

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