http://blog.kzfmix.com/pymolProgramming, Music, SnowboardingjaSat, 31 Mar 2007 23:55:33 +0919http://blog.kzfmix.com/entry/1175352933<p>Wiiリモコンを使って<a href="http://pymol.sourceforge.net/">PyMOL</a>をLet's Note R4上で動かしてみたのでXactiで撮ってみた。</p> <p><object width="425" height="350"><param name="movie" value="http://www.youtube.com/v/LLqODyq8m9U"></param><embed src="http://www.youtube.com/v/LLqODyq8m9U" type="application/x-shockwave-flash" width="425" height="350"></embed></object></p> <p>Bluetooth USBアダプタは安いやつってことでBT-Mini2EDRを選択。</p> <p><p><div class="awsxom"> <a href="http://www.amazon.co.jp/exec/obidos/ASIN/B000JMJQZO/ref=nosim/kaerutyuuihou-22"> <img src="http://ecx.images-amazon.com/images/I/31a04bWyuJL._SL160_.jpg" align="left" hspace="5" border="0" alt="ProductName" class="image" /> <strong>PLANEX Bluetooth2.0+EDR対応USBアダプタ BT-Mini2EDR</strong></a><br /> <br /> プラネックス / ?円 ( 2006-11-30 )<br /> <br /> <br clear="all" /> </div></p></p> <p>パソコンにリモコンを認識させたら、<a href="http://onakasuita.org/wii/">WiinRemote</a>でWiiリモコンをマウスとして操作。</p> <p>結局、傾きとボタンの組み合わせで回転したりズームしたりしてるだけだけなので、思い通りに動かすのにちょっと苦労するんだけど、出来合いのものをチョロッと動かして見せるようなプレゼンのときにはいいかもしれん。</p> <p>今のところマウスの方が圧倒的に操作性がいいんだけど、センサーバーを使ってきちんとイベントをアサインすれば、Wiiで遊んでいるようなような操作感が得られて、いい感じのデバイスになるような気はする。</p> <p>こういうデバイスが使えるようになるとViewerのほうも調子のいいものが求められるようになっていく気がする。</p> <p>例えば、遠くから眺めてるときは、リガンド-サーフェース(タンパク質)として表現されていて、ズームしていってアクティブサイト近くになるとAtom-Atomのスティック表現になったりとか、さらに、置換基-アミノ酸のレベルまでズームすると軌道とかで表現したりとかシームレスに切り替わる(google mapsみたいに)ような。</p> <p>そんなViewer欲しい。</p>Sat, 31 Mar 2007 23:55:33 +0919chemoinformaticsbioinformaticspymolhttp://blog.kzfmix.com/entry/1170251001<p>今日は終日、javascript+activeXObjectでWEBからインタラクティブに操作できるビューアーがないか調べていたヨ。開発中が多くていまいちいいのが見つからないというか、javascriptもactiveXもほとんどいじったことがないでよくわからないというのが正直なところ。</p> <p>pyMOLもcueMOLもスクリプトで制御できるのでWSHとかperlとかでガリガリやればできるとは思うんだがこれだとまぁ、インタラクティブではないよなぁ。</p> <p>あー、javascriptとかactiveXまじめに取り組もう。</p> <ul> <li><a href="http://pymol.sourceforge.net/">http://pymol.sourceforge.net/</a></li> <li><a href="http://cuemol.sourceforge.jp/ja/index?FrontPage">http://cuemol.sourceforge.jp/ja/index?FrontPage</a></li> <li><a href="http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/">http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/</a></li> </ul>Wed, 31 Jan 2007 22:43:21 +0919javascriptpymol