http://blog.kzfmix.com/BioinformaticsProgramming, Music, SnowboardingjaWed, 17 May 2006 22:06:13 +0919http://blog.kzfmix.com/entry/1147871173<p>文献あさってたらrecursive feature eliminationというSVMから記述子の重みを推定するらしき方法を見つけたのでRでできんもんかと探した。</p> <p>結局探せなかったんだけど、Feature Selectionのためのツールを少し見つけたのでメモ。</p> <p><a href="http://tolstoy.newcastle.edu.au/R/help/06/01/18385.html">Looking for packages to do Feature Selection and Classification</a></p> <ul> <li>random forest (varSelRF)</li> <li>caMassClass</li> </ul> <p>あと、バイオインフォでもやっぱ使われてるのね。後で読もう</p> <p><a href="http://statcatjr.exblog.jp/2843757/" title="プリチャードの読学紀行 : Regularized Least Squares Cancer Classifiers from DNA microarray data">プリチャードの読学紀行 : Regularized Least Squares Cancer Classifiers from DNA microarray data</a> <blockquote>Classifier の中でもSVM とRegularized Least Squares （正則化最小二乗法）を比較した文献。 正則化最小二乗法はを使うことでSVMでの計算量の多さを低減し、未知のサンプルの遺伝子発現が少ない際に、その利点を発揮する、ということらしい。</blockquote></p>Wed, 17 May 2006 22:06:13 +0919RBioinformatics